最新要闻

广告

手机

iphone11大小尺寸是多少?苹果iPhone11和iPhone13的区别是什么?

iphone11大小尺寸是多少?苹果iPhone11和iPhone13的区别是什么?

警方通报辅警执法直播中被撞飞:犯罪嫌疑人已投案

警方通报辅警执法直播中被撞飞:犯罪嫌疑人已投案

家电

今日最新!易基因-单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序

来源:博客园

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。


(资料图片)

易基因单细胞甲基化测序&单细胞转录组测序

高通量单细胞DNA甲基化测序简介

单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术,传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。目前单细胞甲基化研究主要受限于检测成本、不同细胞位点检测共有性差异等。

高通量单细胞甲基化scRBS技术指标:

  • 起始量:单细胞;
  • 高通量:上百成千个单细胞快速高通量甲基化检测;
  • 数据量:单细胞1G测序数据;
  • 覆盖度:每个单细胞覆盖4-10M的CG位点;
  • 重复性:不同单细胞CG位点覆盖重复性可到达50%以上;
  • 分辨率高:单碱基分辨率;
  • 性价比高:单个细胞检测费用低至千余元。
多个单细胞检测CG位点的重复性高度一致

单细胞转录组测序(smart-seq2)简介

Smart-seq2技术在单细胞水平对带Poly(A)的RNA进行全长转录组扩增及高通量测序,能够满足高灵敏度、低偏好性的cDNA扩增,得到全长转录本,实现高水平的序列模板转换。

Smart-seq2技术有较好的覆盖范围,可检测到稀有转录本,无需额外的专业设备,应用范围较广,可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA-seq 的应用范围。

技术优势:

  • 起始量低:1-1000个细胞或10pg-10ng total RNA即可高效扩增;
  • 转录本覆盖度高:通过双端引物扩增全长cDNA,获得全转录组信息,避免3’端和5’端偏好性,产物完整性好;
  • 检测灵敏度高:大幅度增加了低表达基因的检出量;
  • 碱基分辨率高:可达单碱基分辨率,且可以定位到具体基因的具体转录本;
  • 实验可控:质控点多,可从实验的开端判断细胞状况。

相关阅读:

Nature | 易基因DNA甲基化测序助力人多能干细胞向胚胎全能8细胞的人工诱导

技术推介|单细胞转录组测序(smart-seq2)

技术推介|高通量单细胞甲基化测序技术介绍(sc-RBS)

技术推介 | 单细胞及微量样本DNA甲基化测序(Micro DNA-BS)

关键词: