最新要闻
- 男主角是明星的小说有哪些?男主角是明星的小说推荐
- 科比最后一场比赛是什么时候?科比最后一场比赛是多少分?
- 鞋子防臭的小妙招有哪些?鞋子防臭喷雾哪个牌子好?
- 沙棘如何鉴别好坏?沙棘的功效作用与主治是什么?
- 玉碎了代表什么征兆?玉碎了有什么办法修复吗?
- 今日热议:4999元 小米13限量定制色明天首销:只有5万台
- 环球焦点!中国民营火箭朱雀二号发射失利 全球首型轨道飞行的甲烷火箭
- 当前播报:QQ邮箱推实用新功能:英文文档一键即可翻译
- 【报资讯】丰田凯美瑞看呆!新一代本田雅阁实车曝光:比思域还运动
- 撞到快报废!特斯拉高速追尾大货车 司机身亡:现场视频速度快到可怕
- 单手就能用的折叠屏旗舰!OPPO Find N2今天发布:比直板机还轻
- 环球视讯!反对无效!日本投放广告宣传福岛核污水安全性:必须排海
- 【环球播资讯】我国成功发射遥感三十六号卫星!长征火箭年发射数首次迈上50大关
- 【环球速看料】适合男女双打 这三款游戏拉近你和她的距离
- 焦点滚动:腾讯互动阅读App《一零零一》宣布将停运:补偿方案出炉
- 环球新动态:显卡不会便宜了?NV要发新RTX 4080、4090:移动版也万元节奏
手机
iphone11大小尺寸是多少?苹果iPhone11和iPhone13的区别是什么?
警方通报辅警执法直播中被撞飞:犯罪嫌疑人已投案
- iphone11大小尺寸是多少?苹果iPhone11和iPhone13的区别是什么?
- 警方通报辅警执法直播中被撞飞:犯罪嫌疑人已投案
- 男子被关545天申国赔:获赔18万多 驳回精神抚慰金
- 3天内26名本土感染者,辽宁确诊人数已超安徽
- 广西柳州一男子因纠纷杀害三人后自首
- 洱海坠机4名机组人员被批准为烈士 数千干部群众悼念
家电
当前视讯!易基因|NSUN2介导RNA m5C修饰促进食管鳞状细胞癌进展的表观调控机制 | 肿瘤研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。
2021年8月3日,中山大学肿瘤防治中心华南肿瘤学国家重点实验室研究团队在《Oncogene》杂志发表了《NSUN2-mediated RNA 5-methylcytosine promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via LIN28B-dependent GRB2 mRNA stabilization》的研究论文,该研究通过RNA-BS、RNA-seq等技术揭示NSUN2介导的RNA m5C甲基化修饰通过LIN28B依赖性GRB2 mRNA稳定促进食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)的进展。
标题:NSUN2-mediated RNA 5-methylcytosine promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via LIN28B-dependent GRB2 mRNA stabilization
【资料图】
时间:2021.08.03
期刊:Oncogene
影响因子:IF 8.756
技术平台:RNA-BS、mRNA-seq
样本:7个ESCC患者肿瘤组织(实验组)+ 7个肿瘤附近正常组织(对照组)
研究思路:
研究摘要:
5-甲基胞嘧啶(m5C)是一种参与许多关键生物过程的转录后RNA修饰,,但其在人类癌症中的作用尚不清楚。本研究通过检测食管鳞状细胞癌(ESCC)中转录组范围的m5C谱,发现由于m5C甲基转移酶NSUN2的过表达,ESCC肿瘤中的m5C甲基化水平增加。NSUN2异常表达受E2F转录因子1(E2F1)的正向调控, NSUN2高表达预示ESCC患者生存率低。此外NSUN2沉默抑制了NSUN2敲除小鼠模型中ESCC肿瘤的发生和进展。从机制上,由新型m5C介质蛋白lin-28同源物B(LIN28B)介导的NSUN2诱导生长因子受体结合蛋白2(GRB2)的m5C修饰并使其mRNA稳定,GRB2上调增加了PI3K/AKT和ERK/MAPK信号的激活。这些结果表明,NSUN2通过GRB2转录本的m5C-LIN28B依赖性稳定来促进ESCC的发生和进展,为ESCC提供了一种有前景的表观转录组靶向治疗策略。
背景意义:
食管鳞状细胞癌 (ESCC) 是恶性程度最高的癌症之一, 5年生存率仅为 19% 。由于缺乏有效的治疗方式,大多数 ESCC患者最终死于癌症的进展 。因此,迫切需要进一步阐明 ESCC的综合分子机制,以开发更有效的ESCC诊断和治疗干预措施。
最近的发现表明,表观遗传调控的异常(如RNA甲基化)是肿瘤发生、进展和复发的重要标志。5-甲基胞嘧啶 (m5C) 是最广为人知和最保守的 RNA 修饰之一。 NSUN2是催化哺乳动物 mRNA m5C修饰的主要甲基转移酶,新出现的证据表明,NSUN2介导的RNA m5C甲基化在细胞增殖、发育和分化中起着关键作用 。 NSUN2的突变或异常表达与多种疾病有关,如癌症和发育障碍。然而,关于NSUN2介导的mRNA m5C修饰在人类疾病,尤其是人类癌症中的精确调控机制知之甚少。
结果图形
(1)NSUN2异常上调在 ESCC 中起致癌作用
图1:ESCC患者NSUN2表达上调与不良临床结局相关。
(A-B) 肿瘤组织和正常组织中NSUN2(A)或NSUN6(B) mRNA的表达水平
(C) 不同时期肿瘤组织中NSUN2 mRNA的表达水平
(D) 不同NSUN2 mRNA 水平患者的Kaplan-Meier 分析
(E) 肿瘤组织和正常组织中的NSUN2蛋白水平
(F-G) 肿瘤组织和正常组织中 NSUN2 蛋白水平的代表性免疫组织化学染色 (IHC) 图像(F)与评分(G)
(H) 不同时期肿瘤组织中NSUN2 蛋白水平的代表性免疫组织化学染色 (IHC) 评分
(i)不同NSUN2蛋白水平患者的Kaplan-Meier 分析
(2)NSUN2表达受 E2F1 正调控
图2:转录因子E2F1正向调控ESCC中的NSUN2表达
(a) NSUN2启动子区域中潜在转录因子的分析
(B-C) 正常与敲低转录因子的ESCC 细胞中NSUN2 mRNA的表达水平(B)与蛋白质水平(C)
(D) NSUN2启动子中推定的 E2F1 结合位点的示意图和用于染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析的引物
(E) 使用抗 E2F1 抗体或 IgG 对细胞进行 ChIP-qPCR
(F) 在指定质粒或 siRNA 共转染 48 小时的细胞中进行荧光素酶报告基因检测
(G) 肿瘤组织和正常组织中E2F1的表达水平
(H) NSUN2表达水平与E2F1的表达水平的Spearman相关性分析
(3)NSUN2 促进ESCC 的肿瘤发生和进展
图3:NSUN2促进ESCC细胞的恶性表型,增强NSUN2基因敲除小鼠的肿瘤发生和发育
(A-H) ESCC 细胞增殖(A-B、E-F)、迁移和侵袭(C-D、G-H)能力的测定
- 4-NQO诱导的ESCC小鼠模型的时间线示意图
(J) Nsun2 +/+ 小鼠4-NQO 戒断 4 周或 8 周后正常食管或食管组织的病理学特征(上)或 NSUN2 水平(下)
(K-M) 在4-NQO 停药 12 周后,Nsun2 +/+ 小鼠(n = 10)及Nsun2 +/−(n = 10)小鼠的食管形态学图像 ( K )、肿瘤数量 ( L ) 或肿瘤大小 ( M )
(N) 在 4-NQO 停药 12 周后,Nsun2 +/+ 小鼠及Nsun2 +/- 小鼠食管的病理学特征(上)或 NSUN2 水平(下)
(O) Nsun2 +/+ 小鼠与Nsun2 +/- 小鼠的Kaplan-Meier 分析
(4)NSUN2介导的 m5C高甲基化激活ESCC中的PI3K/AKT 和 ERK/MAPK 信号
图4:NSUN2诱导ESCC中m5C高甲基化并激活PI3K/AKT和ERK/MAPK信号
(A-B) 肿瘤组织和正常组织(n = 7)之间 m5C 位点的差异甲基化水平的热图(A)分布图(B)
(C) 肿瘤组织vs正常组织中具有m5C高甲基化转录本的基因的典型通路分析
(D) 参与10个典型癌症相关通路的45个代表性基因的甲基化水平热图
(E) 参与这些癌症相关通路的基因示意图
(F-G) 肿瘤组织和正常组织中参与癌症通路的代表性高甲基化基因的m5C-RIP-qPCR或RNA-BisSeq结果
(H) 肿瘤中NSUN2 转录本水平与m5C 转录本水平的Spearman相关性分析
(i)过表达或敲低NSUN2的ESCC细胞中,(F)中提到的转录本的相对m5C水平
(J-K) Western blotting实验
(5)GRB2是 NSUN2诱导PI3K/AKT和ERK/MAPK信号的关键靶点
图5:NSUN2通过增强GRB2 mRNA稳定性来诱导致癌PI3K/AKT和ERK/MAPK信号
(A-B) Western blotting实验
(C-D) 过表达或敲除NSUN2 的ESCC 细胞中GRB2 mRNA 表达水平 (C)和蛋白质水平 (D)
(E-F) 野生型、突变体的GRB2 mRNA表达水平 ( E ) 和蛋白质 水平( F )
(G) GRB2、p-AKT、p-MEK 或 p-ERK 在Nsun2 +/+ 小鼠不同病理阶段的食管组织中的表达水平
(H) 在 4-NQO 停药 12 周后,Nsun2 +/+ 小鼠及其Nsun2 +/- 小鼠食管组织中GRB2、p-AKT、p-MEK 或 p-ERK的表达水平
(I-J) GRB2 mRNA表达水平与NSUN2 mRNA(I)或GRB2 m5C修饰水平(J)的Spearman相关性分析
(K-L) mRNA稳定性测试
(M) 荧光素酶报告基因测定
(6)LIN28B鉴定GRB2的m5C修饰并稳定GRB2 mRNA
图6:LIN28B通过鉴定m5C位点来稳定GRB2 mRNA
- KYSE30 细胞中有或无m5C修饰的蛋白质与 50 bp GRB2探针结合的散点图
- 对从 RNA pull-down 测定中获得的潜在GRB2 [m 5 C] 结合蛋白进行Western blotting实验
- 使用未甲基化或甲基化的GRB2探针对纯化的 flag 标记的 LIN28B 进行 RNA 电泳迁移率变动 (REMSA) 分析
- 用纯化的flag标记的LIN28B对GRB2[m5 C]探针进行REMSA分析
- IGV图
(F-G) PAR-CLIP-qPCR检测
(H) NSUN2降低对LIN28B蛋白水平的影响
- 野生型和突变型中LIN28B与GRB2结合情况
(J) 正常组织和肿瘤组织中LIN28B mRNA的表达水平
(K) GRB2 mRNA表达水平与LIN28B mRNA表达水平的Spearman相关性分析
(L-N) 敲低LIN28B对GRB2 mRNA 表达水平( L ) 和蛋白质水平(M)及GRB2 mRNA 半衰期(N)的影响
(O) 荧光素酶报告基因测定
(7)GRB2 是ESCC的致癌基因,NSUN2-GRB2 轴与 ESCC 具有临床相关性
图7:NSUN2-GRB2轴在ESCC中的临床意义
(A-B) 肿瘤组织和正常组织中GRB2 mRNA的表达水平
(C) 不同GRB2 mRNA水平患者的Kaplan-Meier 分析
(D) 不同GRB2 m5C水平患者的Kaplan-Meier 分析
(E) 肿瘤组织和正常组织中GRB2的蛋白水平
(F-G) 肿瘤组织和正常组织中 GRB2 蛋白水平的代表性免疫组织化学染色 (IHC) 图像(F)与评分(G)
(H) 不同GRB2蛋白水平患者的Kaplan-Meier 分析
- ESCC标本中NSUN2和GRB2蛋白水平的相关性代表性图像
(J) ESCC标本中NSUN2水平与相应的GRB2表达的IHC染色的统计分析
(K) GRB2 IHC评分与NSUN2 IHC评分的Spearman相关性分析
(L) E2F1-NSUN2-m5 C/LIN28B-GRB2-PI3K/AKT和ERK/MAPK信号轴在ESCC肿瘤发生和进展中的调控机制模型
结论:
本研究利用RNA-BisSeq和 RNA-Seq技术,揭示了NSUN2-m5C-GRB2-PI3K/AKT 和 ERK/MAPK 信号在 ESCC的发生和进展中的恶性作用。这些发现说明了m5C介导的ESCC的表观遗传调控机制,同时强调了 ESCC表观转录组靶向治疗的机会。
关于易基因RNA m5C甲基化测序(RNA-BS)技术
m5C是RNA百余种修饰中研究较多的一种。m5C存在于tRNA上时,可以对翻译进行调节;存在于rRNA上时,可以对核糖体的生物合成进行质控;存在于mRNA上时,则可以影响mRNA的结构、稳定性及翻译过程。
易基因提供适用于不同科研需求的m5C甲基化测序技术:
- 常规mRNA m5C甲基化测序(RNA-BS):mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。
- 常规mRNA +lncRNA m5C甲基化测序(全转录组RNA-BS):
易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐处理后,结合高通量NGS策略,可在全转录组范围内单碱基分辨率地检测基因m5C甲基化修饰分布。
技术优势:
- 高深度:超高深度重亚硫酸盐处理,检测准确性极高;
- 高通量:结合高通量NGS,全转录组范围内检测;
- 单碱基:单碱基分辨率,快速检测和分析RNA中的m5C。
- 高准确:精确的检测mRNA等每一个C碱基的的修饰水平。
研究方向:
- 与m6A甲基化类似,m5C甲基化已被证明与肿瘤、神经系统紊乱、代谢性疾病、病毒感染以及个体发育等密切相关。
- 此外,RNA甲基化(m5C)与人类疾病密切相关,其功能涉及调控干细胞应激、细胞毒性应激、mRNA出核和植物细胞发育及基因表达等方面。
实验策略:
易基因RNA m5C甲基化建库测序示意图
易基因科技提供全面的RNA甲基化研究整体解决方案,技术详情了解请致电易基因。
参考文献:
Su J, et al. NSUN2-mediated RNA 5-methylcytosine promotes esophageal squamous cell carcinoma progression via LIN28B-dependent GRB2 mRNA stabilization. Oncogene. 2021 Sep;40(39):5814-5828.
相关阅读:
干货:手把手教你做RNA m5C甲基化测序分析(RNA-BS)
技术推介|RNA m5C甲基化测序(RNA-BS)
深度综述:RNA m5C修饰的生物学及在肿瘤发生和免疫治疗中的作用
亮点:RNA-BS技术揭示m5C甲基化修饰的水稻高温适应性调控新机制
NSUN2介导RNA m5C修饰促进食管鳞状细胞癌进展的表观调控机制 | 肿瘤研究
http://www.egenetech.com
-
当前视讯!易基因|NSUN2介导RNA m5C修饰促进食管鳞状细胞癌进展的表观调控机制 | 肿瘤研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。2021年8月3日,中山大学肿瘤防治中心...
来源: 当前视讯!易基因|NSUN2介导RNA m5C修饰促进食管鳞状细胞癌进展的表观调控机制 | 肿瘤研究
ThingsBoard前端项目的安装与启动
【时快讯】RELIC库学习
全球看热讯:喜讯+1!袋鼠云数栈技术团队获“2022年度优秀开源技术团队”
投影仪的工作原理是什么?投影仪排名前十的品牌
Centos安装Nginx
针孔无线摄像机怎么连接?针孔无线摄像机怎么用?
本地连接受限制或无连接是怎么回事?本地连接受限制或无连接怎么解决?
svchost.exe占用cpu过是什么原因?svchost.exe占用cpu过高解决方法
pdf文件打开是乱码怎么回事?pdf文件打开是乱码时该怎么办?
男主角是明星的小说有哪些?男主角是明星的小说推荐
科比最后一场比赛是什么时候?科比最后一场比赛是多少分?
鞋子防臭的小妙招有哪些?鞋子防臭喷雾哪个牌子好?
沙棘如何鉴别好坏?沙棘的功效作用与主治是什么?
玉碎了代表什么征兆?玉碎了有什么办法修复吗?
英雄联盟更新慢是什么原因?英雄联盟更新慢怎么办?
怎么才能加快迅雷的下载速度?加快迅雷下载速度的方法有哪些?
全球讯息:阻止Windows未知应用弹窗的一种思路方法
Zabbix6.0使用教程 (四)—zabbix6.0从源代码安装
Tomcat工作原理
小键盘指法是什么意思?小键盘指法包括什么键?
iphone13如何添加公交卡?iphone13添加公交卡的方法有哪些?
安卓系统的手机有哪些?安卓系统的手机有哪些牌子好?
天天快讯:针对某钓鱼网站的渗透测试
【脚本项目源码】Python制作桌面宠物,这么可爱的萌宠你不想拥有吗?
今日热议:4999元 小米13限量定制色明天首销:只有5万台
环球焦点!中国民营火箭朱雀二号发射失利 全球首型轨道飞行的甲烷火箭
当前播报:QQ邮箱推实用新功能:英文文档一键即可翻译
【报资讯】丰田凯美瑞看呆!新一代本田雅阁实车曝光:比思域还运动
撞到快报废!特斯拉高速追尾大货车 司机身亡:现场视频速度快到可怕
单手就能用的折叠屏旗舰!OPPO Find N2今天发布:比直板机还轻
环球视讯!反对无效!日本投放广告宣传福岛核污水安全性:必须排海
【环球播资讯】我国成功发射遥感三十六号卫星!长征火箭年发射数首次迈上50大关
【环球速看料】适合男女双打 这三款游戏拉近你和她的距离
焦点滚动:腾讯互动阅读App《一零零一》宣布将停运:补偿方案出炉
环球新动态:显卡不会便宜了?NV要发新RTX 4080、4090:移动版也万元节奏
世界新消息丨法国2-0摩洛哥 决赛战阿根廷!网友发现规律:姆巴佩进球就不会输
快消息!Vue核心概念与其指令
Wireshark使用笔记
焦点!Zabbix监控系统
世界快资讯丨Kubernetes Volumes 笔记
取代奔腾/赛扬!Intel 12代Alder Lake-N处理器来了:清一色小核、超低功耗
环球即时看!德国樱桃收购瑞典外设品牌Xtrfy:对方只有12人
当前信息:国六B汽油要全面上线了!听说这玩意又贵又不耐烧?
环球关注:Wi-Fi 7:明年下半年见
天天看点:App流畅度提升88%!小米承诺:所有升级MIUI 14机型均支持光子引擎
全球要闻:雷军:全面对标苹果iPhone 一个新的小米开始了
环球滚动:[WPF] MediaElement播放HDR视频泛黄、颜色显示不正确应该如何解决?
R数据分析:冲击流图与热图的做法以及多图布局
简讯:VUE简介
天天微头条丨意外之喜:苹果给iPhone 6s/7推送iOS 15.7.2系统更新
焦点精选!脱口秀演员直播带货:想得美好
直播:今年最后一场大型流星雨来了!双子座流星雨压轴登场
游戏性能被RX7900反超?《巫师3》次世代版4090光追演示
天天信息:摩托罗拉×潘通 “非凡洋红”限定版新机来了
Python3.7.3环境搭建
全球观点:哈希表总结
当前报道:2022 ICPC 杭州站 K - Master of Both // Trie
RTX 4080为何要定价这般高?背后原因揭开
【环球热闻】面对矿卡 老黄已经悄悄带头冲锋了!一箭双雕 真是绝了
环球短讯!旧版微博拜拜:大量用户被直接改为新版界面
全球新动态:工信部出手!手机预装App终于能卸载了:2023年执行
切勿模仿!男子让幼儿握方向盘开车还拍摄炫耀:扣3分、罚200
4G已够用 美国运营商推5G陷入麻烦:4200亿投资难赚回来
全球简讯:Intel Arc显卡驱动升级:吃鸡快了4%、还有16个Bug
百事通!玩家最担心的事要发生!AMD RX 7900系列大概率涨价
天天微资讯!CDPR确认《巫师3》次世代版存在Bug:将尽快修复
高玩一步到位 阿斯加特32GB DDR5-6800 RGB灯条1350元
精选!浅析JWT Attack
记录--uniapp 应用APP跳转微信小程序
天天滚动:用 ChatGPT 来完成笔试题
MYSQL 3 DAY
世界热点评!第一百一十三篇: JS数组Array(二)数组方法 栈、队列、排序
世界快资讯丨《流浪地球2》公布星尘海报:人类的勇气永刻星空
全球快播:原因不服不行 大巴黎官方:我们已锁定世界杯冠军!梅西/姆巴佩争金靴
世界热讯:《死侍3》确认为R级!休·杰克曼将回归饰演金刚狼
环球快报:奇瑞SUV颜值天花板!俄罗斯花滑“千金”喜提OMODA C5:定制车身
微头条丨工资加倍都招不到人!官方要求北京快递业人员应返岗尽返岗
环球时讯:行业方案 | 新规落地,企业集团财务公司如何构建数智财务体系?
环球实时:模板层之标签 自定义模板语法 模板的继承与导入 搭建测试环境 ORM常用关键字
最强护眼屏!moto X40蓝光占比远低于行业均值
当前速看:为了让人多下游戏?特斯拉推出1TB车规级固态硬盘
世界实时:奥迪新车开了半小时咚咚响 4S店换零件车主想换车
当前看点!5年研发投入1000亿!小米发布首部知识产权白皮书:授权专利超2.9万项
每日速读!Redmi K60要用上陶瓷/素皮了?卢伟冰在线征集偏好:陶瓷第一
微头条丨Prometheus技术分享——如何监控宿主机和容器
当前视点!人类核聚变取得突破性进展:什么是核聚变、重要吗?
【热闻】闷声发大财 奇瑞第四代混动专用1.5L发动机下线:油耗大降
世界微头条丨7单元发声设计!小米Sound Pro智能音箱开售 首发999元
世界最新:小米13 Pro绝配!小米50W立式风冷无线充Pro图赏
全球热议:跑分突破133万!努比亚Z50《原神》半小时稳成直线
天天关注:学习 Shell准没错
天天速讯:Python3 编程面试题
焦点讯息:快递代拿项目 (第十组)终稿
焦点速看:面试题:浏览器输入 URL 后回车发生了什么?
破坏系统是为了更稳定?混沌工程在去哪儿的 4 个阶段实践
世界观点:产品分享:Qt鸿图电子智慧白板(适合会议机、电子黑板、电子笔记、电子阅读器等场景),当前版本v1.0.0
win7游戏不能全屏怎么解决?win7游戏不能全屏解决方法有哪些?
酷狗可以下载歌词吗?酷狗怎么下载歌词?
itunes怎么制作铃声?itunes备份文件在哪里?